Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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EFEMP1Q12805 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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EFEMP1Q12805 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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