Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNMA1Q12791 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNMA1Q12791 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms