Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms