Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLFN5Q08AF3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLFN5Q08AF3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms