Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms