Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms