Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEUP1Q05D60 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms