Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A2Q05940 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms