Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIN1Q05586 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms