Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms