Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms