Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP7AQ04656 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms