Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms