Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms