Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms