Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MYBPC1Q00872 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms