Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms