Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms