Protein–RNA interactions for Protein: P62308

SNRPG, Small nuclear ribonucleoprotein G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPGP62308 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPGP62308 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPGP62308 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms