Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTBP60709 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTBP60709 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms