Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAV3P56539 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAV3P56539 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAV3P56539 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms