Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms