Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COPAP53621 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COPAP53621 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPAP53621 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPAP53621 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms