Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP98P52948 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUP98P52948 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP98P52948 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP98P52948 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms