Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THOP1P52888 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
THOP1P52888 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THOP1P52888 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THOP1P52888 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms