Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms