Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLK1P49759 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLK1P49759 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLK1P49759 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms