Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCAMP43121 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms