Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDF5P43026 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDF5P43026 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GDF5P43026 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GDF5P43026 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms