Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC1A3P43003 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms