Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MDH1P40925 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MDH1P40925 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MDH1P40925 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MDH1P40925 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MDH1P40925 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MDH1P40925 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MDH1P40925 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MDH1P40925 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms