Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM6P40199 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM6P40199 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM6P40199 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CEACAM6P40199 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CEACAM6P40199 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms