Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGP37231 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms