Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM23P36406 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms