Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCGF2P35227 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms