Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP1P30622 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP1P30622 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms