Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKLRP30613 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKLRP30613 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKLRP30613 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKLRP30613 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKLRP30613 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKLRP30613 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms