Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB3P28472 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms