Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB9P28065 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms