Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms