Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKACBP22694 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms