Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FGFR3P22607 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FGFR3P22607 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms