Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL1P22362 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms