Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms