Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB1P20618 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms