Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PGCP20142 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGCP20142 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGCP20142 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGCP20142 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms