Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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CXCL3P19876 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CXCL3P19876 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CXCL3P19876 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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