Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF3P18847 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATF3P18847 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATF3P18847 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF3P18847 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms