Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHCEP18577 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHCEP18577 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHCEP18577 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms