Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGA2P17301 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms